Análisis de genomas completos

Ensamblaje genómico completo o parcial  (10-120 contigs) de microorganismos aislados. El servicio incluye: secuenciación (Hiseq 2500 2×125 paired end), ensamblaje y anotación. Adicionalmente puede cumplimentarse con diferentes análisis de  genómica comparativa: identificación de ortólogos, alineamiento genómico, contextualización filogenética, análisis de multilocus (MLSA), caracterización del pangenoma, genoma accesorio o genes de interés (patogenicidad, resistencia, virulencia). Además de los archivos de  secuenciación, se entregará el genoma ensamblado y anotado junto con un informe técnico completo a  fin de proporcionar una descripción precisa del mismo.

MÁS INFORMACIÓN

DIRIGIDO A

Agricultura y ganadería

Caracterización de pre y probióticos (determinación de cepas microbianas: bacterianas y fúngicas).

Secuenciación de patógenos (microorganismos y virus) aislados.

Secuenciación de bacterias aisladas para la mejora de biofertilizantes.

Caracterización genómica de patógenos potenciales en cultivos.

Salud: Clínicas, hospitales y farma

Monitorización de salas blancas y caracterización genómica de cepas durante episodios epidémicos.

Caracterización de virus y microorganismos nosocomiales.

Monitorización funcional de dietas.

Caracterización de resistomas.

Industria de bienes de consumo

Secuenciación de fermentos o starters mejorados.

Caracterización de starters.

Protección industrial de starters y patentes.

Detección de biomarcadores.

Caracterización de funciones enzimáticas asociadas a cepas industriales.

Centros de investigación

Caracterización genómica: regiones específicas, islas genómicas, plásmidos, tipado genómico.

Estudios genómicos comparativos en bacterias de relevancia ecológica/patógenas.

Caracterización de genomas de cepas patógenas.

Detección de biomarcadores y funciones enzimáticas.

COMPROMETIDOS CONTIGO

Genomas secuenciados completamente y drafts de alta calidad

Anotación en múltiples categorías funcionales

Análisis estadísticos y genómica comparativa

Informe detallado personalizado y rápida entrega de resultados (12 semanas)

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