Metagenómica fúngica

Conoce el perfil fúngico de una muestra secuenciando el espaciador transcrito interno (ITS), ampliamente utilizado en taxonomía y filogenia molecular. El servicio incluye la utilización de protocolos de extracción de DNA específicos para hongos, preparación de librerías,  secuenciación Illumina Miseq 300×2 y análisis bioinformáticos y estadísticos. Garantizamos la robustez y consistencia de nuestra pipeline mediante la incorporación de controles (negativo y Mock Community) a lo largo del proceso. Durante todo el servicio garantizamos un soporte constante aportando dos informes intermedios y uno final.

MÁS INFORMACIÓN

DIRIGIDO A

Agricultura y ganadería

Caracterización del microbioma asociado a plantas.

Análisis de interacciones fúngico-bacterianas: micorrizas y endófitos

Efecto de pre y probióticos en el fungoma animal.

Detección de potenciales patógenos en cultivos vegetales.

Salud: Clínicas, hospitales y farma

Diagnóstico clínico: Informes personalizados (intestinal, oral, vaginal) dirigidos a pacientes.

Clínicas odontológicas: Monitorización de patógenos bucodentales.

Identificación de biomarcadores de interés

Industria de bienes de consumo

Monitorización de productos biofermentados.

Crisis profilácticas: Zoonosis y patógenos humanos.

Centros de investigación

Estudios ambientales: oceánicos, suelos, aguas continentales.

Detección de biomarcadores y estudios ambientales.

Perfiles microbianos asociados a diferentes ambientes.

Interacciones simbiónticas.

COMPROMETIDOS CONTIGO

Asesoramiento durante el diseño experimental

Calidad q30 garantizada para el 70% de tus secuencias

Pipelines personalizadas y diferentes barcodes disponibles

Disponibles estudios mixtos con metagenómica bacteriana 16S

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